人工流产是避孕失败不得已的补救措施，婚后即人工流产或未婚先孕而人工流产，对今后的生育有些影响。有不少年轻女性，在初次怀孕后，因患了感冒、风疹等病，或是因服了某些药物，就片面以为会导致胎儿发育不全，而执意做人流手术；也有不少年轻女性有婚前性行为，怀孕后只好借助于人流手术。这些做法于健康极为不利。
母婴血型不合的妇女唯有在第一胎产出健康胎儿的可能性大，首次怀孕后若是做人流手术，其后再怀孕，多会发生新生儿溶血病。
人工流产虽然不是大手术，但是少数人会发生一些并发症，如附件炎、盆腔炎、宫腔粘连、输卵管阻塞、月经失调，甚至造成继发不孕等，而且以后怀孕发生自然流产的机会比未做工人工流产的妇女多。未生育的妇女其子宫颈较紧，易造成手术中的损伤和以后的宫腔粘连。如多次人工流产，发生以上不良后果将更为严重，有些并发症可以治疗，有少数病例治不好。
还潜在以后怀孕及分娩的危险，如早产、前置胎盘、胎盘粘连、残留、大出血。人工流产是强行终止妊娠，不同于自然流产，会导致乳房乳腺肿块，诱发乳腺小叶增生、乳腺炎等。